Die Entwicklung eines Interreg- (Voll-) Antrages kann ein erhebliches Maß an Aufwand, Zeit und ggf. auch Kosten (Arbeitszeit, aber auch Reiskosten für Treffen der Projektpartner, etc.) mit sich bringen. Um dem gerecht zu werden, bietet das Programm die Möglichkeit an, die Erstattung von Vorbereitungskosten zusammen mit der Full Application zu beantragen. Voraussetzung ist die vorherige positive Bewertung einer Expression of Interest.

Wenn das Projekt aufgrund der Full Application genehmigt wird, wird eine Pauschale in Höhe von 20.000 Euro für Projektvorbereitungskosten im Rahmen der ersten Erstattung gewährt. Auch bei mehrfacher Antragstellung vor einer Genehmigung wird diese Summe nur einmal gezahlt.